A harmadik �vadban Michael, Mahone, Bellick �s T-Bag t�rsas�g�ban ism�t b�rt�nben raboskodik, ez�ttal Panam�ban. Ezt a fegyint�zetet k�v�lr�l �rzik, hogy k�nnyebben elej�t vegy�k a l�zad�soknak.

A C�g egyik embere, Gretchen Morgan zsarolja Lincolnt a fi�val �s Saraval. Ha �lve akarja �ket viszontl�tni, cser�be Scofieldnak ki kell hoznia a b�rt�nb�l James Whistlert, aki a b�rt�n alatti csatornah�l�zatban rejt�zk�dik a panamai igazs�gszolg�ltat�s el�l. Aki megtal�lja a f�rfit, az kiszabadulhat a b�rt�nb�l. Mahone mindent bevet annak �rdek�ben, hogy � tal�lja meg el�bb Whislert �s kiadja a helyi drogb�r�nak, Lecheronak.

Id�k�zben Lincoln kapcsolatba l�p Whistler bar�tn�j�vel, akit�l kap egy kulcsot, amellyel egy banklet�t ajtaj�t lehet kinyitni. Az ott tal�lt k�nyvet Lincolnnak �t kell adnia a C�gnek. A f�rfi azonban ragaszkodik hozz�, hogy el�bb l�thassa Sarat �s a fi�t k�l�nben Scofield nem hozza ki Whistlert a b�rt�nb�l. Eljuttatnak hozz� egy f�nyk�pet, amin Sara egy friss �js�got tart a kez�ben. Lincoln �gy �rzi Sara mondani akar valamit, ez�rt megszerzi a b�rt�n egyetlen mobiltelefonj�t, hogy felh�vhassa a n�t. Siker�l kider�tenie, hogy hol tart�zk�dnak, �m mire oda�r az elrabl�k od�bb�llnak. Morgan figyelmezteti, hogy nem �rdemes ilyenekkel pr�b�lkoznia �s eljutatt egy csomagot a hotelszob�j�ba, amiben Sara lev�gott feje tal�lhat�.
Ezzel egy id�ben T-Bag meg�li Lechero egyik ember�t, hogy �tvehesse annak munk�j�t, mint drogdiler. Scofield Mahone sz�m�ra is felk�n�lja a menek�l�s lehet�s�g�t, �m azzal a rejtegetett sz�nd�kkal, hogy id�vel �tv�gja. Mahone azonban r�j�n a dologra �s k�ssel pr�b�lja megfenyegetni Scofieldot.

Egy sikertelen sz�k�s alklam�val T-Bag, Bellick �s Lechero lebukik. Mahone, Whistler, Scofield �s Luis kihaszn�lj�k a helyzetet �s lel�pnek a ker�t�sen kereszt�l. Scofield ezut�n egy m�zeumban megszervez egy tal�lkoz�t, hogy kicser�lj�k Whistlert Lincoln fi�ra �s Sofiara. Miut�n Lincoln visszakapja a fi�t, Scofield bossz�t esk�szik Gretchen ellen, mert az meg�lte Sarat. A harmadik �vad v�g�n T-Bag meg�li Lecherot, aki p�nzt szerzett neki, hogy megvesztegess�k a korrupt b�rt�n�r�ket.